孙女儿的户口与爷爷坐牢无直接关联，可按正常程序处理。分析：从法律角度来看，爷爷坐牢是其个人的法律责任问题，不会直接影响到孙女儿的户口。户口的登记、迁移等是按照国家户籍管理规定来执行的，与家庭成员的刑事记录无关。孙女儿的户口在妈妈那边，如果一切正常，无需因爷爷的事情而变动。提醒：若户口管理机关以爷爷坐牢为由拒绝办理相关手续，或孙女儿因此受到不公平待遇，表明问题已较严重，应及时寻求律师或户籍管理部门的帮助。
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处理方式：从法律角度，处理此类问题主要有两种方式：一是按照户籍管理规定正常办理户口相关手续；二是如遇到阻碍，可申请行政复议或提起行政诉讼。选择方式：若户口管理机关按照正常程序办理，则无需采取其他措施；若遇到不合理阻碍，应先尝试沟通解决，沟通无果后再考虑行政复议或诉讼。
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具体操作：1. 正常情况下，孙女儿户口在妈妈那边，按照户籍管理规定，如需迁移、变更等，应提供相应材料，如出生证明、父母身份证、户口簿等，到户籍管理机关办理。2. 如遇到户籍管理机关以爷爷坐牢为由拒绝办理，应首先与户籍管理机关沟通，明确告知其法律规定，并尝试提供法律依据。3. 沟通无果后，可向上一级户籍管理机关申请行政复议，或向人民法院提起行政诉讼，要求确认其拒绝办理的行为违法，并责令其履行法定职责。4. 在整个过程中，建议保留好所有与户籍管理机关沟通的记录，以及提交的材料复印件，以备不时之需。